在受到大規(guī)模全球緊急情況的挑戰(zhàn)時(shí),，如何科學(xué)有效應(yīng)對是全球面臨的共同現(xiàn)實(shí),。新冠肺炎大流行為科學(xué)開啟了巨大的機(jī)遇,，并讓科學(xué)在這之中充分發(fā)揮了作用,。其中,，以閃電般的速度開發(fā)疫苗就是核心技術(shù)能力的體現(xiàn),，基因組測序亦然,。

　　1月11日,，世界衛(wèi)生組織舉行新冠肺炎例行發(fā)布會，總干事譚德塞表示,，病毒傳播得越廣,，變異的可能性就會增加。最關(guān)鍵的是,，我們可以有效地對病毒進(jìn)行測序,，從而了解病毒是如何變化的以及我們該如何應(yīng)對。雖然診斷工具和疫苗對當(dāng)前的病毒仍然有效，但未來我們有可能需要進(jìn)行調(diào)整,。

　　上周,，世衛(wèi)組織發(fā)布了一項(xiàng)全面的實(shí)施指南和風(fēng)險(xiǎn)監(jiān)測框架，以幫助各國建立具有影響力的基因測序方案,。

　　基因測序利于追蹤病毒和疫情防控

　　這份針對基因測試實(shí)施的指南稱,，新冠病毒基因測序可以用于許多不同的領(lǐng)域，包括改進(jìn)診斷,、制定對策和疾病流行病學(xué)調(diào)查,。

　　疫情暴發(fā)早期，新冠病毒基因組序列的共享使分子診斷分析得以迅速發(fā)展,，這提高了全球針對疫情的防備能力,，并有助于各國制定對策�,？焖�,、大規(guī)模的病毒基因組測序有助于理解病毒流行的動態(tài)和評估防控措施的有效性。

　　現(xiàn)在,，科學(xué)的發(fā)展已經(jīng)允許我們在病例確診后數(shù)小時(shí)或數(shù)天內(nèi)對新冠病毒進(jìn)行測序,。實(shí)時(shí)基因組測序能夠?yàn)楣�共衛(wèi)生部門對大流行的反應(yīng)提供信息。

　　越來越多的人認(rèn)識到病毒基因組測序有助于促進(jìn)公眾健康,。因此,，也有更多國家的實(shí)驗(yàn)室在這一領(lǐng)域進(jìn)行投資。然而,，指南表示,，基因測序涉及的成本和工作量是巨大的,，各國實(shí)驗(yàn)室需要對這項(xiàng)投資的預(yù)期公共衛(wèi)生回報(bào)有一個(gè)清晰的想法,。

　　指南還警示稱，盡管基因測序有“把關(guān)人”的存在,，但重要的是,，那些制定目標(biāo)、進(jìn)行基因組分析和使用結(jié)果數(shù)據(jù)的人要意識到基因測序受某些力量主導(dǎo)而存在的局限性,，以及潛在的偏見來源,。

　　基因測序?qū)嵤┬柚苊芸紤]和詳細(xì)規(guī)劃

　　這份指南對各國如何實(shí)施基因測序給出了詳細(xì)指導(dǎo)。指南稱,，在開始基因測序計(jì)劃之前,，重要的是要清楚地了解測序的目標(biāo)、分析戰(zhàn)略和如何利用研究結(jié)果為公共衛(wèi)生反應(yīng)提供信息的計(jì)劃,。新冠肺炎大流行的每個(gè)階段都會提出對公共衛(wèi)生至關(guān)重要的不同挑戰(zhàn),，要想應(yīng)對其中某些挑戰(zhàn)，需要我們采取不同的基因組采樣策略。

　　關(guān)于實(shí)施基因測序的相關(guān)注意事項(xiàng),，指南稱,，基因測序目標(biāo)的決定應(yīng)該在包括所有利益相關(guān)者的高級代表的多學(xué)科框架內(nèi)做出。同時(shí),，為確�,？沙掷m(xù)的支撐，應(yīng)確定測序所需資金來源,，包括專家人員,、測序設(shè)備和消耗品的成本，以及處理和存儲數(shù)據(jù)所需的計(jì)算架構(gòu),。實(shí)驗(yàn)室也應(yīng)仔細(xì)評估是否存在倫理方面的問題,。此外，實(shí)驗(yàn)室還應(yīng)對其選定方案中的每一步驟進(jìn)行生物安全風(fēng)險(xiǎn)評估,。

　　在基因測序的目標(biāo)方面,，實(shí)驗(yàn)室應(yīng)說明有關(guān)用于基因測序和樣本選擇方法的技術(shù)考慮。當(dāng)前,，有幾種設(shè)備可用于新冠病毒基因組測序,。由于每次讀取數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性、產(chǎn)生的數(shù)據(jù)量和周轉(zhuǎn)時(shí)間的不同,，每種設(shè)備在特定情況下或許都有一定的適用性,。

　　為實(shí)現(xiàn)基因測序目標(biāo)，大多數(shù)情況下,，病毒序列數(shù)據(jù)和樣本元數(shù)據(jù)都是必需的,。獲取此類數(shù)據(jù)并將其轉(zhuǎn)換為正確的分析格式可能需要大量資源，但是也有助于最大限度地發(fā)揮測序的潛在影響,。

　　此外,，指南還提到，基因樣本在運(yùn)輸,、存儲,、檢測中如何保存完整性、對數(shù)據(jù)結(jié)果如何科學(xué)分析和解釋以避免誤解都是需要考慮的,。

　　指南還表示,，無論產(chǎn)生多少新冠病毒基因組序列，只有為隨后產(chǎn)生和傳播有用和及時(shí)的結(jié)果制定戰(zhàn)略,，它們才會對公共衛(wèi)生產(chǎn)生積極影響,。

　　基因測序網(wǎng)絡(luò)離不開全球共享與互補(bǔ)合作

　　“如果我們想要更好地為未來的威脅做好準(zhǔn)備，就必須將基因組測序加速整合到全球衛(wèi)生界的實(shí)踐中,�,！笔佬l(wèi)組織傳染病危害管理部門主管西爾維·布萊恩德在這份指南的前言中稱,，“我們希望這一指導(dǎo)將有助于為準(zhǔn)備工作鋪平道路�,！�

　　指南表示,，許多分析依賴于將本地獲得的病毒序列與全球病毒基因組多樣性進(jìn)行比較的能力。因此,，適當(dāng)?shù)毓蚕聿《净�因組序列是至關(guān)重要的,，例如在GISAID和GenBank等資料庫中，全球共享數(shù)據(jù)正在進(jìn)行時(shí),。

　　指南鼓勵(lì)各國加大互補(bǔ)合作,，以確保最大限度地發(fā)揮現(xiàn)有能力。例如,，一些國家可能需要提高建設(shè)相應(yīng)實(shí)驗(yàn)室的能力,，而另一些國家可能決定將實(shí)際基因測序工作外包，并將重點(diǎn)放在生物信息學(xué),、數(shù)據(jù)管理和數(shù)據(jù)解釋上,。

　　“建立一個(gè)強(qiáng)大和有彈性的全球基因測序網(wǎng)絡(luò)可以最大限度地提高測序?qū)�公眾健康的影響，不僅對新冠病毒,，對未來出現(xiàn)的病原體也是如此,。”指南中寫道,。

　　在11日的例行發(fā)布會上,，譚德塞也表示，世衛(wèi)組織呼吁所有國家增加對新冠病毒的基因測序并在全球范圍內(nèi)共享這些數(shù)據(jù),，以補(bǔ)充正在進(jìn)行的監(jiān)控,、檢查和檢測工作。

　　病毒無國界,，它是我們?nèi)�人類面臨的共同挑戰(zhàn),。世界各國是命運(yùn)共同體，無人能置身其外,，獨(dú)善其身,，只有聯(lián)合起來，才能戰(zhàn)勝困難,。

　　◎?qū)嵙?xí)記者 張佳欣